真武庙俗称“上帝公宫”，位于丰泽区东海街道法石社区石头山。据说此为真武大帝的八闽第一行宫，是以有“南武当”之称。又说南宋末年赵昰、赵昺两幼帝南逃至泉州后曾在此驻跸过，故也称“圣殿”。法石为晋江下游江海交汇处，东距后渚港6.5公里，为泛洋、入泉的水陆交通咽喉之地，是宋元时期繁华的港口要镇。庙祀真武大帝，又称玄天上帝，为镇守北方天界之神。根据阴阳五行说法，北方属水，《重修纬书集成》卷六《河图》载真武大帝是“北方七神之宿，实始于斗，镇北方，主风雨”，故真武大帝有祈雨晴佑平安护海航之神威，是继通远王之后的泉州第二代海神。
《闽杂录》中记载了玄天上帝来源的另一种传说：“上帝公，五代时泉州人，姓张，杀猪为业，事母至孝。母嗜猪肾，虽高价亦不售，留归奉母。母死后一日，顿悔杀生过多，罪恶深重，乃走至洛阳桥畔，以屠刀剖腹，投肠肚于江中，遂成佛。后其肠化为蛇，胃化为龟，每兴风作浪，又显灵收之。故民间庙祀者极多，所塑金身，都穿盔甲，手执剑，一脚踏龟，一脚踏蛇，其状降伏二妖也。”“龟蛇镇江”成为洛阳桥八景之一。旁有玄天上帝化身处，青石上仿似有血迹斑斑。可见也是与海洋有关。
庙始建于北宋乾德五年至开宝六年间（-）。此时的泉州已是中国四大通商口岸之一，在留从效（-）治理下重加版筑，“环植刺桐”，有了“刺桐城”之美称。清源军节度使陈洪进（-）继续推行保境安民，大力发展海外贸易的政策，曾“入贡乳香万斤，象牙三千斤，龙脑香五斤”，可见当时海外贸易之繁盛。泉州在海外贸易中已占鳌头，然而大海神秘莫测，风涛险恶，人们为了增强信心，祈求海航平安，10－14世纪泉州地方官员每年都在真武庙兴行祭海活动，与九日山祈风共祷海事顺利。明万历《泉州府志》载：“玄武庙在郡城东南石头山，庙枕山漱海，人烟辏集其下，宋时为郡守望祭海神之所。”清道光《晋江县志》亦载：“真武庙在三十六都郡城东南石头山上。庙枕山漱海，人烟辏集其下。宋时建，为郡守望祭海神之所。”
真武庙大殿南宋两知泉州的真德秀曾于真武庙祭海和祈雨，留有《真武殿祝文》和《北斗真武殿祈雨青祠》。《祝文》为：“于皇上圣威，神在天诞，降福泽于民，俾有宁宇。某之祗事，为日久矣。叨恩分阃，而灵宫在焉。涖事之初，敬伸谒欵。江湖之间，沴气易作，尚惟慈悯，弭于未然。区区之诚，仰蕲昭鉴。”《青祠》如下：“伏以凡民有生，莫切丰年之望。不雨斯极，预怀艰食之忧。惟上圣之至仁，为群元之司命，恭伸祷请，愿赐矜怜，霈甘霖于久旷之余，全嘉谷于将枯之际；庶获成于中熟，实仰戴于殊恩。”
明清之际，泉州海外贸易日渐式微，不再举行与海航相关的祭海与祈风活动，乾隆年间真武庙已不再见于官方祀典。真武庙渐渐从官方视野中消失，成了法石铺境民间庙宇。据庙中石刻记载，清道光后真武庙又颇受
